De opleidingen van de faculteit Biomedische Technologie worden verzorgd in samenwerking met de Universiteit Maastricht (UM), met name de faculteit "Health, Medicine and Life Sciences", en het academisch ziekenhuis Maastricht (azM). Ook op het gebied van onderzoek bestaan er nauwe banden tussen TU/e, UM en azM. Dit komt bijvoorbeeld tot uitdrukking in de hoeveelheid aanstellingen van deeltijd hoogleraren in elkaars instellingen.